盘点 | 全球单细胞测序上游企业(上)发表时间:2022-06-13 12:11 单细胞测序技术指的是通过高通量测序技术(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。 2011年,Nature Methods 将单细胞测序列为年度值得期待的技术之一。2013年,Science将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首。 近年来,单细胞测序领域更是备受关注。 实际上,早期的单细胞以 RT-PCR 技术为主,随着科技的发展,其逐渐被测序(单细胞基因组和转录组等)取代,从低通量发展到高通量(加以蛋白组方面的质谱技术等)。 单细胞测序实验及分析的流程一般包括:单细胞制备、单细胞分离、文库制备、高通量测序和生物信息分析。分为上游(单细胞制备、分选、文库制备和测序)、中游(测序服务和生物信息分析)和下游分析(应用)。 据单细胞测序网不完全统计,目前单细胞测序上游企业有20家以上。今天,小编将带大家认识一下其中12家单细胞测序上游企业(排序不分先后)。 BD 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备) BD(Becton, Dickinson and Company)是一家全球化的医疗技术公司,通过改善医学发现方法、医疗诊断效果和护理质量以引领世界健康。 BD Rhapsody™ 单细胞测序平台利用Cytoseq蜂窝板技术,在20万个微孔中进行mRNA捕获,因此可以叫做“微孔捕获”。该单细胞多组学分析系统能够对成千上万个单细胞的蛋白与基因进行数字定量,提供灵活的定制化Panel及标准化应用方案,以满足不同的实验需求,其独特的混样技术可有效节约时间与成本。 MGI (华大智造) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库 (试剂)及测序设备 华大智造专注于DNA测序仪器、试剂及相关产品的研发、生产和销售,为精准医疗、精准农业、精准医疗等相关行业提供实时、全景、全生命周期的设备和系统。 华大智造是临床高通量基因测序仪的领先生产商,其多组学平台包括基因测序、医学成像和实验室自动化。 其DNBelab C系列细胞组学整体产品组合,基于独特的DNBelab C系列单细胞文库制备技术和强大的DNBSEQ测序技术,由DNBelab C4便携式单细胞系统、DNBelab C系列单细胞RNA文库制备套装,搭配华大智造DNBSEQ系列测序平台,以及相关的单细胞分析软件构成,可实现便携式、即时化、一站式单细胞组学研究全流程。 10x GENOMICS 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备) 10x GENOMICS成立于2012年,专注于单细胞测序。公司通过将创新的微流体技术,试剂和生物信息学相结合,使全球的研究人员能够以前所未有的分辨率和通量加速探索研究,改善人类健康。 2016年2月,10X Genomics推出主要产品Chromium单细胞转录组测序平台,该平台利用微流控、油滴包裹和baecode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术,能够一次性分离、并标记500–10000个单细胞,从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。 作为单细胞转录组测序技术主流平台之一,10x Genomics平台能实现大规模的单细胞转录组测序,具有细胞通量高、细胞捕获率高、项目周期短等优点,并广泛应用于细胞异质性、免疫细胞群体检测及构建细胞图谱等研究。 QIAGEN(凯杰) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂) QIAGEN是全球领先的从样本制备到数据解读完整解决方案供应商,服务于全球80多个国家和地区的超过五十万名客户,涵盖分子诊断、应用检测、制药和生命科学研究。 QIAGEN拥有业内领先的解决方案,包括: • QIAscout单细胞分离技术 • QIAseq单细胞文库构建方案 • REPLI-g单细胞全基因组及全转录组扩增方案 • miScript单细胞miRNA研究方案等 除单细胞全基因扩增产品REPLI-g Single Cell Kit外,QIAGEN还推出了单细胞WTA以及从少量细胞同时扩增WGA&WTA的解决方案,产物适合于多种应用,包括二代测序、基于芯片技术的比较基因组杂交、焦磷酸测序和real-time PCR分析。 FLUDIGM(富鲁达) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备)及蛋白质谱 Fluidigm(富鲁达)成立于1999年,主要针对的市场包括质谱流式检测、高通量基因组学和单细胞基因组学研究。主要销售的产品包括生物仪器和消耗型微流体芯片。 Fluidigm的微流控芯片Fluidigm C1芯片就像一个电路,单细胞悬液导入后,单个细胞会被引入独立的腔室。一张芯片有96个腔室,所以一次最多允许96个细胞平行独立进行裂解、反转录和PCR扩增。 反转录扩增过程中,每个细胞的cDNA会被接上特异的接头序列,保证后续混合测序后还能重新独立拆分每个细胞的数据。 MERCK(默克) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备)CRISPE 默克集团(Merck KGaA)创建于1668年,总部位于德国达姆施塔特市(Darmstadt),主要致力于创新型制药、生命科学以及前沿功能材料技术, 并以技术为驱动力,为患者和客户创造价值。 默克GenomePlex® Single Cell Whole Genome Amplification kit单细胞全基因组扩增试剂盒:
Mission bio 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备) Mission Bio于2012年在硅谷成立,专注于高通量单细胞水平的分子诊断和基因组精准医疗。 2017年,Mission Bio推出Tapestri平台。该平台基于“droplet-based”微流控原理,结合靶向PCR扩增技术,可对特定的DNA目标序列进行单细胞水平的建库和分析,同时检测来自同一细胞的单核苷酸变异(SNV)、拷贝数变异(CNV)和蛋白质数据的单细胞多组学平台。Tepastri平台能够并行分析数万个单细胞,可检测癌症中1%的稀有细胞,还能监测癌症治疗期间的突变共生,来帮助优化针对精准癌症疗法的临床试验。 Singleron(新格元) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备) 新格元生物成立于2018年,专注高通量单细胞多组学平台产品的自主开发及临床转化。公司拥有国际领先的一站式高通量单细胞测序平台,提供从组织样本处理,高通量单细胞分离及测序文库构建,到数据分析和临床意义挖掘的全面解决方案。 现有产品包括自主开发生产的Singleron Matrix®自动化单细胞测序文库构建仪器,Singleron PythoNTM组织解离仪,GEXSCOPE®高通量单细胞转录组试剂盒、单细胞核转录组试剂盒、免疫受体试剂盒、DynaSCOPETM海量单细胞转录组动态监测试剂盒、FocuSCOPETM靶向高通量单细胞测序产品、AccuraCode®高通量药物筛选RNA建库试剂盒、CeleScopeTM生信分析软件及SynEcoSys®单细胞数据库。 新格元自主研发的单细胞微流芯片文库构建技术,采用物理沉降原理,“纯自然,无公害”,对中性粒细胞等脆弱的细胞类型更加友好,能够获得组织中比例较少的中性粒细胞,为疾病的发病机制探究提供了更多的可能性。 10K GENOMICS (万乘基因) 主营单细胞业务:单细胞分选与建库(试剂和设备) 万乘基因于2018年2月成立,专注于未来细胞测序分析技术的整体解决方案开发,主要包括高通量单细胞多组学测序及空间多组学测序两大方向,公司英文名10K Genomics,意指单次可以分析上万个细胞或组织区域。 公司于2021年率先推出第一款国产高通量微流控单细胞测序仪PerseusTM,并在2021及2022年陆续推出单细胞转录组及表观组试剂解决方案。 2022年3月3日,万乘基因正式发布空间转录组测序平台,该平台有以下重要特征: (1)对同一切片进行HE或荧光染色的同时,进行空间转录组测 (2)更高灵敏度的RNA捕获技术。 (3)灵活的分辨率。 厚泽生物 主营单细胞业务:文库质控 杭州厚泽生物科技有限公司主要从事科学仪器、耗材、试剂的销售推广和售后服务,是一家专业的科学仪器和试剂的供应商,是服务于全国科研、医疗市场的科技型科学仪器贸易公司。 厚泽生物推出的Qsep全自动毛细管电泳仪,可以以较低的成本完成对文库片段大小及浓度的质控,且灵敏度高,可准确地检测接头残留情况,是现在NGS实验室值得考虑的质控技术。 Agilent(安捷伦) 主营单细胞业务:文库质控 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)成立于1999年,总部位于美国加利福尼亚州,是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,致力于提供敏锐洞察与创新,帮助提高生活质量。 安捷伦自动化电泳仪提供了一系列试剂盒,可兼容多种样品类型和分子量,可提供准确可靠的分子量测定、定量和摩尔浓度。此外,每种仪器均采用专为平台优化的特定质量指标,可对样品完整性进行客观评估。尽管不同类型的仪器质量指标的计算有所不同,但最终的质量评分在不同平台间具有很高的可比性。多篇文献均证明自动化电泳仪非常适合这类重要的 QC 步骤,不仅适用于传统的 NGS 文库制备,还可用于故障排除和方案优化,以及为复杂或独特样品开发定制工作流程。 Illumina 主营单细胞业务:单细胞分选与建库 (试剂)及测序设备 Illumina是测序行业的龙头企业,总部位于美国加利福尼亚圣地亚哥,其专注成为全球基因测序和芯片技术的领导者,并为全球范围的科研、临床和应用市场客户提供专业服务。 Illumina的产品有NovaSeq 6000系统、NextSeq 2000测序系统等。其NextSeq 2000测序系统采用业界出色的Illumina 边合成边测序(SBS)化学技术作为全面scRNA-Seq工作流程的一部分,具有强大的功能和灵活性,可满足多种多样的项目需求。NextSeq 2000测序系统提供了两种测序通量模式,为研究人员使用多种NGS分析方法增加了灵活性,并且可以适应各种实验设计。如果需要甚至更高的样本通量,可利用NovaSeq™ 6000系统开展研究,将每次运行样本扩展到数百个。 |