曹罡教授、Seurat开发者Satija实验室张冰洁博士、10x Genomics林然博士齐聚第五期《壹细胞菁英论坛》

发表时间：2022-05-17 14:31



5月18日晚上，曹罡教授、Seurat开发者Satija实验室张冰洁博士、10x Genomics林然博士等大咖齐聚《壹细胞菁英论坛》直播间，共探单细胞前沿技术成果。

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以下为详细嘉宾介绍：

曹罡，华中农业大学，农业微生物学国家重点实验室教授，中组部“万人计划”领军人才，科技部中青年创新人才获得者。长期从事新兴生物技术开发，尤其是单细胞空间组学（原位测序），单细胞三维基因组学新技术的开发及其在神经免疫与感染交叉学科和肿瘤等疾病检测中的运用。近五年来在Nature Genetics, Neuron, Science Advance, Molecular Neurodegeneration, Nucleic Acids Res, JACC,Nature Communication, Science Bulletin等一流刊物发表论文24篇，获批专利多项。主持参与十三五重大研发计划，基金委重点项目、联合基金重点项目，面上项目多项。获中华医学科技二等奖。

代表文章：
1. Lin, D., Hong, P., Zhang, S., Xu, W., Jamal, M., Yan, K., Lei, Y., Li, L., Ruan, Y., Fu, Z. F., Li, G., & Cao, G. (2018). Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture. Nature genetics, 50(5), 754–763.
2. Yu, J., Xiao, K., Chen, X., Deng, L., Zhang, L., Li, Y., Gao, A., Gao, J., Wu, C., Yang, X., Zhou, Q., Yang, J., Bao, C., Jiao, J., Cheng, S., Guo, Z., Xu, W., Cao, X., Guo, Z., Dai, J., … Cao, G. (2022). Neuron-derived neuropeptide Y fine-tunes the splenic immune responses. Neuron, 110(8), 1327–1339.e6.
3. Xiao, K., Xiong, D., Chen, G., Yu, J., Li, Y., Chen, K., Zhang, L., Xu, Y., Xu, Q., Huang, X., Gao, A., Cao, K., Yan, K., Dai, J., Hu, X., Ruan, Y., Fu, Z., Li, G., & Cao, G. (2021). RUNX1-mediated alphaherpesvirus-host trans-species chromatin interaction promotes viral transcription. Science advances, 7(26), eabf8962.
张冰洁，博士毕业于清华大学，现在New York Genome Center从事博士后研究工作。致力于开发single cell multi-omics technology来探究免疫细胞分化过程中的命运决定。Fellow of Jane Coffin Childs Memorial Fund for Medical Research。

代表文章：
1. Zhang, B., Srivastava, A., Mimitou, E., Stuart, T., Raimondi, I., Hao, Y., Smibert, P., & Satija, R. (2022). Characterizing cellular heterogeneity in chromatin state with scCUT&Tag-pro. Nature biotechnology, 10.1038/s41587-022-01250-0. Advance online publication.
艾珊珊，博士生导师。开发并利用单细胞多组学技术解析心脏发育及再生过程中细胞命运决定及转变的表观分子调控机制。2020年于北京大学获博士学位。2020年加入南方医科大学生理学教研室。以共同第一作者身份在Nature Cell Biology, Molecular Cell, Elife, Circulation Research等SCI期刊发表5篇原创性论文。开发了两种具有普适性的单细胞ChIP-seq技术，分别命名为itChIP-seq (indexing and tagmentation-based ChIP-seq)和CoBATCH (combinatorial barcoding and targeted chromatin release)。

代表文章：
1. Ai S #, Xiong H#, Li CC, Luo Y, Shi Q, Liu Y, Yu X, Li C, He A*. Profiling chromatin states using single-cell itchip-seq. Nature cell biology. 2019;21:1164-1172. (IF=20.04, JCR1区)
2. Wang Q#, Xiong H#, Ai S#, Yu X#, Liu Y#, Zhang J, He A*. Cobatch for high-throughput single-cell epigenomic profiling. Molecular Cell. 2019;76:206-216. (IF=15.58, JCR1区)
3. Li Y#, Ai S#, Yu X#, Li C, Li X, Yue Y, Wei Y, Li CY*, He A*. Replication-independent histone turnover underlines the epigenetic homeostasis in adult heart. Circulation research. 2019:198-208. (IF=14.47, JCR1区)
4. Ai S#, Yu X#, Li Y#, Peng Y, Li C, Yue Y, Tao G, Li C, Pu WT, He A*. Divergent requirements for ezh1 in heart development versus regeneration. Circulation research. 2017;121:106-112. (IF=14.47, JCR1区)
林然博士是10x Genomics 亚太区资深科学技术顾问，在单细胞、空间和基因测序领域有着超过十三年的科研及工作经验。在加入10x Genomics之前，他是Illumina大中华区资深行业市场经理，主管基础科研及应用市场的业务；他还先后任职于Bio-Rad Laboratories和ASM Pacific Technology，担任高级应用科学家和产品开发工程师等职务。林然于香港科技大学和浙江大学分别获得生物医学工程学博士及学士学位，从事单细胞、微流控及Bio-MEMS的相关研究，曾发表及合署中英文论文十余篇，并多次在MicroTAS, Transducers, NEMS等国际会议上做口头报告。
曾今诚，男，1983年生，湖南郴州人，副研究员，宾夕法尼亚大学国家公派联合培养博士，广东医科大学医学技术/临床检验诊断学硕士生导师，广东湛江海洋医药研究院博士后合作导师，东莞市医学活性分子开发与转化重点实验室主任，广东省医学分子诊断重点实验室管理办公室主任、中国防痨协会老年结核病防治专业分会委员、中华预防医学会微生态学专业委员会中医药微生态学组委会委员、广东省生物医学工程学会健康工程分会委员、广东省抗癌协会肿瘤代谢专业委员会委员、东莞市转化医学专业委员会委员。近年来主要从事细胞代谢与疾病免疫调控机制研究、医学活性分子筛选及转化研究、医用细胞免疫生物学特性和临床诊疗转化策略研究。至今以第一或通讯作者在Emerg Microbes Infect、Front Immunol、J Leukoc Bio、J Transl Med等杂志发表SCI收录论文30余篇；论文总引用量800余次，h指数18。获授权国家发明专利6件，实现专利成果转让1件。先后主持国家及省级项目6项、市厅级项目8项、参与十三五国家科技重大专项1项、省科技重大专项1项。受邀担任《微生物免疫学进展》杂志编委、《中华生物医学工程杂志》青年编委和国内外多家杂志特邀审稿专家。先后获创新东莞青年科技创新奖（2021）、东莞百优创新科技专家（2021）、南方人才杯第四届“赢在广州”大学生创业大赛伯乐奖和广东医科大学优秀共产党员等多项荣誉称号。至今培养及联合培养硕士研究生毕业12名，在读7名。


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