提高多路复用和通量水平！Bruker等企业于AACR上发布空间蛋白质组学新平台

发表时间：2022-05-27 13:37作者：Fiona
在2022 美国癌症研究协会年会（AACR 2022）上，空间蛋白质组学抢占了一部分焦点。Bruker、Standard BioTools等企业发布了新平台，能够提供更高水平的多路复用和通量；Akoya Biosciences公司展示了PhenoCycler-Fusion系统的数据。
Bruker-AmberGen、PhenoCycler-Fusion系统多路复用能力表明，
空间蛋白质组学领域正处于向高倍数转变的过程

在AACR发布的空间蛋白质组学新平台中，最瞩目的是Bruker和AmberGen公司开发的基于基质辅助激光解吸电离技术（MALDI）质谱成像技术（MSI）的新平台，该平台的推出进一步加强了Bruker对空间生物学的持续推动。
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图片来源：Bruker官网

Bruker总部位于马萨诸塞州比勒里卡，早前，该公司与AmberGen达成合作关系，并完成了一笔战略投资，金额未予披露。
最近，Bruker的子公司Canopy推出了其ChipCytometry技术的下一代版本，这是一种基于荧光显微镜的空间蛋白质组学系统，通过多轮抗体染色来测量组织样本中的几十种蛋白质。
相比之下，Bruker与AmberGen合作开发的新平台则是使用MALDI质谱成像法对组织样本中的肽连接抗体进行测量，这种方式与Standard BioTools和Ionpath等公司采用的基于质谱的方法更为相似。
这种技术将AmberGen的Miralys™试剂盒（antibodies linked to photocleavable mass tags）和Bruker的MALDI质谱平台（尤其是Rapiflex和TimsTOF系统）相结合。研究人员用Miralys™对感兴趣的组织样本进行染色，然后将染色后的样本组织暴露在紫外光下进行光裂解标记，并通过MALDI质谱仪检测。
与Akoya Biosciences、Standard BioTools和Ionpath等公司的空间蛋白质组学平台不同，Bruker-AmberGen的方法并不能提供亚细胞分辨率，但能够实现高度多路复用和高通量。
AmberGen公司的联合创始人兼董事会主席Kenneth Rothschild表示：“利用该系统，研究人员可以对100多种蛋白质进行复用检测，还可以在几乎相同的时间内扫描一个平方厘米大小的组织样本，而像Standard BioTools和Ionpath公司的技术只能扫描一个平方毫米大小的样本。”
Kenneth Rothschild补充说道：“基于质谱的技术是非常好的技术，广泛应用于研究中，但对于研究人员来说，基于质谱的技术要获得完整的概况是非常困难的，而Bruker-AmberGen技术的缺点是无法提供亚细胞分辨率，若两者结合，将会互为补充，能够提供更好的技术支持。”
作为生命科学研究和临床工作的MALDI质谱仪的领先供应商，Bruker公司是MALDI成像的主要市场占有者，但Bruker的MALDI质谱仪大部分工作都集中在代谢物和糖类等小分子上。尽管目前一些学术研究人员，如范德比尔特大学的Richard Caprioli，已经开发了MALDI蛋白质成像的方法，但无可否认这依然是一种技术要求很高的专业方法。
本次与AmberGen基于Ambergen Miralys™ 的合作使Bruker能够对其现有的MALDI质谱仪进行部署布局，打通进军空间生物学的道路。
Bruker生命科学质谱部门成像主管Michael Easterling则表示：“进入蛋白质成像领域是MALDI成像界一直想做的事情，我们相信，凭借高度复用能力和快速分析大型组织样本的能力，该系统将能在空间蛋白质组学领域开辟出一片天地。”

此外，同样在AACR上，总部位于马萨诸塞州马尔堡的Akoya Biosciences公司展示了其PhenoCycler-Fusion系统的数据，研究人员利用该平台以单细胞分辨率分析了全切片样本的100种蛋白质。
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图片来源：Akoya Biosciences官网

而以往，Akoya和其他空间蛋白质组学公司的分析通常在40个蛋白质左右便达到顶峰。

简言之，PhenoCycler-Fusion的数据以及Bruker-AmberGen系统预计的多路复用能力表明，空间蛋白质组学领域正处于向高倍数转变的过程。

Akoya、Standard BioTools优化平台，致力于提高通量


除了多路复用，分析速度也是关键指标之一，特别是当仪器应用于临床研究和临床试验工作的时候。
因此，Akoya也同样致力于提高其平台的通量。PhenoCycler-Fusion被设计成可以在几种不同的模式下运行，以优化多路复用或通量。目前，PhenoCycler-Fusion能以每周约10个样本的速度并行测量多达50个蛋白质，或以每周约100个样本中每个样本测量多达6个蛋白质。
Akoya的目标是在今年年底前实现每周30个样本中每个样本能够测量100个蛋白质的workflow。
此外，在AACR上，总部位于加州南旧金山的Standard BioTools公司也推出了其成像CyTOF系统的最新版本--Hyperion+，其检测极限比以前的系统低1.6倍，而且每周能处理100多个样——比以前的Hyperion系统产量高一倍。

空间生物学市场巨大，制药业有强需求

在AACR会议上，除推出Bruker-AmberGen新平台外，Michael Easterling还表示：“目前，空间生物学的市场容量巨大，而饱和总量十分低，可以容纳更多参与者。”
Michael Easterling提到：“Bruker预估，在同一样本中对蛋白质和小分子测量的能力将会有很强的吸引力。同时，公司预估，制药行业将会有对此有强烈的需求。”
Easterling解释道：“多年来，制药业一直在解决可药用的蛋白质组问题。这需要更清晰地看到蛋白质组的代谢输出，更好了解药物与目标蛋白质之间的作用。”
此外，Easterling还表示：“预计免疫肿瘤学研究将成为空间蛋白质组学另一个主要的发展领域。”


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