映泰科技与元码基因就空间转录组技术肿瘤临床应用达成战略合作

发表时间：2022-05-26 18:30作者：时空组学网

空间转录组测序技术（Spatial Transcriptomics，ST）是站在显微技术和测序技术交汇处的全新技术，同时具备显微技术中的单细胞的空间分辨力和测序技术的碱基水平的分析精度。配合不同的取样时间，可以提供样品时间和空间两个维度的信息，为生命的发生发展，器官功能和细胞命运调控等提供全新的观测维度。2020年，ST技术被Nature Methods评为年度技术，说明了该技术在生命科学领域的潜在价值。


2022年3月，映泰科技发布一项全新的ST技术MatriSeqs 为用户提供单细胞精度，厘米级尺寸，高捕获效率的空间转录组测序技术，希望为研究者提供高度友好的一站式时空图谱绘制解决方案。同时宣布与元码基因开展肿瘤临床应用达成战略合作。

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MatriSeqs技术简介


MatriSeqs是由映泰科技开发的基于原位捕获策略的空间转录组技术。原理上，首先通过MatriSeqs-Slide上数万至数十万的编码位点捕获组织中的mRNA；之后使用异位测序技术对捕获的mRNA进行测序分析；最后，经过生信分析与空间解码将测序信息与编码位点进行比对，重建空间转录组信息。相较于其他基于空间编码的空间转录组技术，得益于独特的编码策略和加工体系，MatriSeqs提供了一种高度灵活的产品体系，为有空间转录组分析需求的科研用户和临床用户提供一个高度客制化的新选择。

关于本次合作


利用映泰科技独有的MatriSeqs空间转录组技术，以及元码基因完整的肿瘤基因检测产品和技术体系，元码基因将联合分布在全国的院内精准医学实验室，开展包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌等在内的肿瘤微环境研究，包括不限于scRNA-seq, 免疫组库，三代测序，scATAC-seq等，为包括免疫治疗、靶向治疗耐药、肿瘤新生抗原等多个领域的临床应用开发，并将开发成果申报临床诊断资质。
映泰科技有限公司CEO 赵海峰说：非常感谢元码团队对我们技术的认可，经过三年多的努力，我们的技术已经稳定，可以成功完成2万个空间像素，2万个基因的检测，希望通过与元码的合作，在肿瘤研究和产业化领域获得样本、技术和临床应用的支持，为未来进入临床做好准备
元码基因科技CTO王伟伟说：我们从一年多前开始对映泰科技的MatriSeqs技术进行测试，经过双方的努力，已经达到我们对空间转录组数据的质控标准，元码临床团队希望应用MatriSeqs技术，对现在肿瘤临床治疗的难点，包括：免疫治疗的有效性、靶向治疗耐药等机制的研究和产业化提供保障，未来，如果有积极的临床进展，元码将基于MatriSeqs技术进行产品的申报和临床推广

关于映泰科技有限公司

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映泰科技成立于2019年，具有多学科背景的研发团队，核心成员由多名业内资深科研人员和海外归国人员组成，专业领域涵盖分子生物学、基因组学、材料学、生物信息学等多个学科。在MatriSeqs技术基础上，开发了完整的空间转录组测序样本制备和分析解决方案。

关于元码基因

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元码基因科技成立于2014年底，是一家基于自主研发精准医学技术，以建设、管理和运营院内精准医学技术平台为核心的高科技企业，拥有第三方医学检验实验室、GMP厂房、获得国家三类医疗器械审批的NGS肺癌六基因检测试剂盒以及完善的技术研发体系，在全国管理和运营超过30家院内精准医学实验室。

参考文献：

  1. F. Tang et al., mRNA-Seq whole-transcriptome analysis of a single cell. Nat Methods 6, 377-382 (2009).

  2. P. L. Stahl et al., Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics. Science 353, 78-82 (2016).

  3. Method of the Year 2020: spatially resolved transcriptomics. Nat Methods 18, 1 (2021).

  4. M. Asp, J. Bergenstrahle, J. Lundeberg, Spatially Resolved Transcriptomes-Next Generation Tools for Tissue Exploration. Bioessays 42, e1900221 (2020).

  5. G. Peng et al., Molecular architecture of lineage allocation and tissue organization in early mouse embryo. Nature 572, 528-532 (2019).

  6. R. R. Stickels et al., Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2. Nat Biotechnol 39, 313-319 (2021).

  7. S. G. Rodriques et al., Slide-seq: A scalable technology for measuring genome-wide expression at high spatial resolution. Science 363, 1463-1467 (2019).

  8. F. Salmen et al., Barcoded solid-phase RNA capture for Spatial Transcriptomics profiling in mammalian tissue sections. Nat Protoc 13, 2501-2534 (2018).

  9. S. Vickovic et al., High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling. Nat Methods 16, 987-990 (2019).

  10. Y. Liu et al., High-Spatial-Resolution Multi-Omics Sequencing via Deterministic Barcoding in Tissue. Cell 183, 1665-1681 e1618 (2020).


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